引用

先天免疫应答的转录程序是宿主保护的关键。然而，将病原体感知与先天激活联系起来的转录机制仍然知之甚少。在HIV-1感染期间，人类树突状细胞(DC)可以通过先天感应途径检测病毒，导致抗病毒干扰素和DC成熟。在这里，我们开发了一种迭代的实验和计算方法来绘制单核细胞衍生dc (MDDCs)中的HIV-1固有反应电路。通过整合全基因组染色质可及性与表达动力学，我们推断出一个基因调控网络，将542个转录因子与21862个靶基因连接起来。我们观察到，干扰素反应是必需的，但不足以驱动MDDC成熟，并确定PRDM1和rara分别是干扰素反应和MDDC成熟的必要调节因子。我们的工作为探究HIV复制和先天免疫的调控因子提供了资源，强调了控制感染反应的调控回路的复杂性和协调性。版权2020作者。由爱思唯尔公司出版版权所有。