引用

4216 总记录数 177 今年的记录

健康志愿者肺泡巨噬细胞LPS激活的全谱转录组分析

皮尼拉-维拉,M;熊,Z;赵,Y;赵,J;多纳霍,MP;巴吉,S;霍恩,WT;科尔斯,JK;麦克弗里,BJ;比鲁科娃,A;泰赫,RM;福斯特,WM;霍林沃斯,J;雷,A;马兰马利,R;雷,P;李,JS;

尽管最近在理解巨噬细胞激活方面取得了进展,但对于健康的人类肺泡巨噬细胞如何校准其对典型TLR4激活的转录反应,我们知之甚少。在本研究中,我们检测了LPS激活的全谱,并确定了人肺泡巨噬细胞的转录组特征是否由含tir结构域的适配器诱导干扰素(TRIF)主导的I型干扰素特征所区分。从健康志愿者身上获得支气管肺泡灌洗液巨噬细胞,在体外存在或不存在超纯LPS的情况下进行刺激,通过RNA测序(RNA- seq)进行整个转录组分析。LPS诱导了强有力的I型干扰素转录反应,而Ingenuity通路分析预测干扰素调节因子(IRF)7是89个已知基因靶点的顶级上游调控因子。泛素特异性肽酶(USP -18)是干扰素/反应的负调控因子,是除IL10和USP41外上调最多的基因之一,USP41是一个生物学功能未知但与USP18序列同源性较高的新基因。我们研究了IRF-7和USP-18是否能影响下游巨噬细胞效应因子IL-10的产生。我们发现IRF-7 siRNA敲低增强了lps诱导的人单核细胞来源的巨噬细胞中IL-10的产生,而USP-18过表达减弱了lps诱导的RAW264.7细胞中IL-10的产生。定量PCR证实USP18、USP41、IL10和IRF7表达上调。一项独立队列研究证实LPS诱导USP41和IL10基因。这些结果表明,IRF-7和预测的下游靶点USP18,这两个由RNA-Seq识别的I型干扰素基因签名的元素,可能通过校准人肺泡巨噬细胞中IL-10的产生来微调早期细胞因子反应。

Baidu
map