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炭疽毒素通道的疏水门控和1/f噪声

雅米尼,G;凯蒂,S;卡鲁,N;蒙本·阿博尔法特,S;莱普拉,SH;阿雅帕,KG;

“Pink”或者1/f噪声是一种自然现象,在物理学、经济学、天体物理学、生物学,甚至音乐和语言中无处不在。在电生理学中,许多生物离子通道和人造纳米孔的随机活性可以用1/的电流噪声来表征f功率谱密度。在炭疽毒素通道(PA63),它表现为导电态和非导电态之间的快速电压无关电流中断。这种行为阻碍了PA的潜在发展63作为离子通道生物传感器。往好的方面想,是私人助理63闪烁是一种令人着迷的现象。值得注意的是,类似于1/f在二元梭菌C2和iota毒素的通道形成成分中观察到波动,它们与炭疽毒素通道在功能和结构上有相似之处。类似于PA63,它们被进化成将毒素的酶成分转移到细胞质中。在此,通过高分辨率单通道脂质双分子层实验和全原子分子动力学模拟,我们认为1/fPA噪声63由于在ϕ-clamp区域发生了“疏水门控”,即先前在几个被疏水带“固定”在内部的充水通道中观察到的现象。ϕ-clamp是PA中的一个狭窄的“疏水环”63由7或8个苯丙氨酸残基在427位形成的管腔,保守在C2和iota毒素通道中,催化蛋白质易位。值得注意的是,1/f在F427A PA中仍未检测到噪声63突变体。这一发现可以阐明1/的功能目的f噪声及其在二元毒素酶组分运输中的可能作用。

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