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自主神经系统，特别是交感神经系统，调节免疫反应，而免疫系统中产生的细胞因子也影响神经元活动。应激诱导的直接早期基因(如大脑中的c-Fos)的表达，以及使用伪狂犬病毒的病毒跨神经元标记，使分析应激相关中枢自主神经系统的神经回路成为可能。边缘系统(杏仁核，侧隔，边缘下，岛状，腹内侧颞皮质区)，以及下丘脑和脑干的几个核已被确定为调节应激诱导的交感神经激活的中心部位。本文综述了杏仁核参与应激诱导的交感神经反应的调节。所有杏仁核亚核都从其他边缘区域接收心理信息，而外侧和中央亚核则从臂旁核和医学膝状核接收感觉和免疫信息。对下丘脑的输出主要来自内侧杏仁核，而对终纹床核的输出主要来自中央杏仁核和内侧杏仁核。性类固醇如雌激素和雄激素可以调节交感神经活动，因为它们的受体表达在内侧杏仁核。