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艰难梭菌通过其主要毒力因子毒素a和毒素b的产生引起一种潜在的致命腹泻疾病。tcdC基因被认为编码一种毒素产生的负调控因子。因此，在tcdC基因型异常的菌株中，毒素产生增加，因此毒性增加。本报告描述了第一个用于艰难梭菌精确遗传操作的等位基因交换系统，使用大肠杆菌的codA基因作为异源反选择标记。它被用来系统地恢复艰难梭菌R20291 (PCR核型027)tcdC基因中自然发生的117移码突变和18个核苷酸缺失。此外，艰难梭菌630 (PCR核型012)天然完整的tcdC基因被删除，然后随后用沉默的核苷酸替代或水印恢复，因此产生的菌株与野生型区分开来。有趣的是，在艰难梭菌R20291或艰难梭菌630中，tcdC基因型和毒素产生之间没有关联。因此，异常的tcdC基因型并不能为PCR核型027菌株是高水平毒素产生者这一概念提供广泛适用的理论依据。这可能很好地解释了为什么一些研究报告说，一个异常的tcdC基因不能预测毒素产生的增加，甚至不能预测毒性的增加。