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描述双侧锥体切开术和前肢肌内基因治疗后颈背根神经节转录变化的RNA测序数据集,使用编码人类神经营养因子-3的腺相关病毒载体

凯瑟琳,C;莫恩,LDF;

成年大鼠髓质金字塔的单侧或双侧皮质脊髓束损伤引起投射到颈脊髓的本体感觉神经元的解剖和生理变化,并伴有高反射和包括痉挛在内的异常行为运动。在之前的一篇论文中,我们发现“肌内神经营养因子-3可使大鼠双侧皮质脊髓束损伤后的低阈值脊髓反射正常化,减少痉挛并改善活动能力”(Kathe et al., 2016)[1]。我们假设神经营养因子-3通过修饰颈背根神经节(DRG)的基因表达诱导这些变化。因此,在这篇数据文章中,我们分析了在之前的研究中从中侧大鼠和双侧锥体切开术(bPYX)大鼠中获得的颈DRGs的转录组(损伤24小时后应用单侧肌注AAV1-CMV-NT3或AAV1-CMV-EGFP)的转录组(Kathe等人,2016)[1]。生物信息学分析使我们能够确定损伤后TrkC+神经元中可能表达的基因,以及哪些基因受神经营养因子-3的调节,其方向与其他数据集中涉及神经营养因子-3的敲除或过表达的预期方向一致。这个数据集将帮助我们和其他人识别感觉神经元中的基因,这些基因的表达水平受神经营养因子-3治疗的调节。这可能有助于确定新的治疗靶点,以改善神经损伤后的感觉和运动。数据已存入基因表达综合数据库(GSE82197), http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?token=avgpicgcjhknzyv&acc=GSE82197。

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