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巨噬细胞在组织炎症反应和调节组织修复方面具有双重作用。在几乎所有急性炎症组织中，巨噬细胞有两种主要亚类共存。这些包括胚胎来源的常驻组织巨噬细胞和骨髓来源的招募巨噬细胞。虽然很明显，以这种方式分类的巨噬细胞子集显示出不同的转录和功能特征，但这些类别中的所有细胞和相同炎症微环境中的所有细胞是否具有相似的功能，或者是否存在进一步的特化，还没有确定。为了在更颗粒的水平上研究炎性巨噬细胞的异质性，我们在小鼠中诱导急性肺炎症，并对健康、炎症高峰和炎症缓解期间从空气中分离的巨噬细胞进行单细胞RNA测序。在此过程中，我们确认了细胞来源是AM编程的主要决定因素，并描述了基于增殖能力和炎症编程的AMs的两个先前未被描述的、转录上不同的分支。